MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 plasmid pZZ6.01

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018146	GAA	2	6	791	796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677587
2	NC_018146	TCC	2	6	957	962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677587
3	NC_018146	CT	3	6	968	973	0 %	50 %	0 %	50 %	397677587
4	NC_018146	CTG	2	6	1072	1077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677587
5	NC_018146	GAA	2	6	1082	1087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677587
6	NC_018146	T	6	6	1178	1183	0 %	100 %	0 %	0 %	397677587
7	NC_018146	ATCA	2	8	1228	1235	50 %	25 %	0 %	25 %	397677587
8	NC_018146	CAT	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677587
9	NC_018146	TG	3	6	1335	1340	0 %	50 %	50 %	0 %	397677587
10	NC_018146	AC	3	6	1407	1412	50 %	0 %	0 %	50 %	397677587
11	NC_018146	TCA	2	6	1418	1423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677587
12	NC_018146	TTG	2	6	1884	1889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677588
13	NC_018146	TCT	2	6	1908	1913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677588
14	NC_018146	GATG	2	8	1927	1934	25 %	25 %	50 %	0 %	397677588
15	NC_018146	GAA	2	6	1952	1957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677588
16	NC_018146	TA	3	6	2031	2036	50 %	50 %	0 %	0 %	397677588
17	NC_018146	TTG	2	6	2090	2095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677588
18	NC_018146	CTT	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677588
19	NC_018146	A	6	6	2232	2237	100 %	0 %	0 %	0 %	397677588
20	NC_018146	T	7	7	2379	2385	0 %	100 %	0 %	0 %	397677589
21	NC_018146	ATC	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677589
22	NC_018146	GAA	2	6	2478	2483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677589
23	NC_018146	GT	3	6	2504	2509	0 %	50 %	50 %	0 %	397677589
24	NC_018146	ATAG	2	8	2664	2671	50 %	25 %	25 %	0 %	397677589
25	NC_018146	AGC	2	6	2743	2748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677590
26	NC_018146	TTG	2	6	2755	2760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677590
27	NC_018146	TTC	2	6	2896	2901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677590
28	NC_018146	GA	3	6	2902	2907	50 %	0 %	50 %	0 %	397677590
29	NC_018146	CTT	2	6	3033	3038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677590
30	NC_018146	CTT	2	6	3171	3176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677591
31	NC_018146	TGG	2	6	3227	3232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677591
32	NC_018146	A	6	6	3271	3276	100 %	0 %	0 %	0 %	397677591
33	NC_018146	TGA	2	6	3281	3286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677591
34	NC_018146	GGTC	2	8	3351	3358	0 %	25 %	50 %	25 %	397677591
35	NC_018146	AGA	2	6	3359	3364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677591
36	NC_018146	TCTA	2	8	4781	4788	25 %	50 %	0 %	25 %	397677592
37	NC_018146	AGA	2	6	4845	4850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677592
38	NC_018146	AT	3	6	4877	4882	50 %	50 %	0 %	0 %	397677592
39	NC_018146	GGC	2	6	4938	4943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677592
40	NC_018146	GCT	2	6	4948	4953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677592
41	NC_018146	CAT	2	6	4982	4987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677592
42	NC_018146	TTA	2	6	4988	4993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677592
43	NC_018146	CTT	3	9	5076	5084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677592
44	NC_018146	GTTA	2	8	5822	5829	25 %	50 %	25 %	0 %	397677593
45	NC_018146	CAT	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677593
46	NC_018146	GTG	2	6	5893	5898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677593
47	NC_018146	T	7	7	5908	5914	0 %	100 %	0 %	0 %	397677593
48	NC_018146	TGT	2	6	5971	5976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677593
49	NC_018146	TCT	2	6	6053	6058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677593
50	NC_018146	T	6	6	6058	6063	0 %	100 %	0 %	0 %	397677593
51	NC_018146	TAT	2	6	6087	6092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677593
52	NC_018146	TA	3	6	6108	6113	50 %	50 %	0 %	0 %	397677593
53	NC_018146	A	6	6	6136	6141	100 %	0 %	0 %	0 %	397677593
54	NC_018146	T	6	6	6158	6163	0 %	100 %	0 %	0 %	397677593
55	NC_018146	TGG	2	6	6175	6180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677593
56	NC_018146	T	6	6	6192	6197	0 %	100 %	0 %	0 %	397677593
57	NC_018146	TCC	3	9	6257	6265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677593
58	NC_018146	GGA	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677593
59	NC_018146	CTT	2	6	6283	6288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677593
60	NC_018146	ATC	2	6	6379	6384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677593
61	NC_018146	A	6	6	6419	6424	100 %	0 %	0 %	0 %	397677593
62	NC_018146	A	6	6	6461	6466	100 %	0 %	0 %	0 %	397677593
63	NC_018146	CTGC	2	8	6484	6491	0 %	25 %	25 %	50 %	397677593
64	NC_018146	TAA	2	6	6571	6576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677593
65	NC_018146	AAC	2	6	6580	6585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677593
66	NC_018146	CG	3	6	6589	6594	0 %	0 %	50 %	50 %	397677593
67	NC_018146	CAA	2	6	6679	6684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677593
68	NC_018146	ATTG	2	8	6766	6773	25 %	50 %	25 %	0 %	397677593
69	NC_018146	CCAAA	2	10	6778	6787	60 %	0 %	0 %	40 %	397677593
70	NC_018146	GCA	2	6	6908	6913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677593
71	NC_018146	TCA	2	6	6962	6967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677593
72	NC_018146	TCT	2	6	7008	7013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677593
73	NC_018146	CGG	2	6	7014	7019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677593
74	NC_018146	GCT	2	6	7047	7052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677593
75	NC_018146	GCGA	2	8	7325	7332	25 %	0 %	50 %	25 %	397677594
76	NC_018146	TGC	2	6	7369	7374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677594
77	NC_018146	TTG	2	6	7433	7438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677594
78	NC_018146	CAG	2	6	7540	7545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677594
79	NC_018146	GAA	2	6	7546	7551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677594
80	NC_018146	TTC	2	6	7563	7568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677594
81	NC_018146	CAAA	2	8	7618	7625	75 %	0 %	0 %	25 %	397677595
82	NC_018146	CAG	2	6	7628	7633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677595
83	NC_018146	AAT	2	6	7636	7641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677595
84	NC_018146	CAA	2	6	7649	7654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677595
85	NC_018146	CGA	2	6	7658	7663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677595
86	NC_018146	CTC	2	6	7674	7679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677595
87	NC_018146	ATG	2	6	7705	7710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677595
88	NC_018146	TCG	2	6	7717	7722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677595
89	NC_018146	GTC	2	6	7734	7739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677595
90	NC_018146	TTG	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677595
91	NC_018146	AT	3	6	8100	8105	50 %	50 %	0 %	0 %	397677596
92	NC_018146	GCT	2	6	8118	8123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677596
93	NC_018146	ACG	2	6	8193	8198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677596
94	NC_018146	GTT	2	6	8250	8255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677596
95	NC_018146	T	8	8	8254	8261	0 %	100 %	0 %	0 %	397677596
96	NC_018146	AG	3	6	8323	8328	50 %	0 %	50 %	0 %	397677596
97	NC_018146	TTC	2	6	8406	8411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677596
98	NC_018146	TCC	2	6	8414	8419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677596
99	NC_018146	CGG	2	6	8512	8517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677596
100	NC_018146	TTC	2	6	8562	8567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677596
101	NC_018146	TTG	2	6	8708	8713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677596
102	NC_018146	CCTGC	2	10	8764	8773	0 %	20 %	20 %	60 %	397677596
103	NC_018146	GCGT	2	8	8777	8784	0 %	25 %	50 %	25 %	397677596
104	NC_018146	CTG	2	6	8813	8818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677596
105	NC_018146	ATC	3	9	8860	8868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677596
106	NC_018146	GCC	2	6	9062	9067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677596
107	NC_018146	CCACA	2	10	9068	9077	40 %	0 %	0 %	60 %	397677596
108	NC_018146	CTT	2	6	9090	9095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677596
109	NC_018146	GAC	2	6	9165	9170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677596
110	NC_018146	GGCATC	2	12	9180	9191	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397677596
111	NC_018146	GCC	2	6	9221	9226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677596
112	NC_018146	CGCA	2	8	9252	9259	25 %	0 %	25 %	50 %	397677596
113	NC_018146	AAGG	2	8	9300	9307	50 %	0 %	50 %	0 %	397677596
114	NC_018146	CGCA	2	8	9308	9315	25 %	0 %	25 %	50 %	397677596
115	NC_018146	AAC	2	6	9340	9345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677596
116	NC_018146	TCA	2	6	9422	9427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677596
117	NC_018146	A	6	6	10571	10576	100 %	0 %	0 %	0 %	397677597
118	NC_018146	A	6	6	10598	10603	100 %	0 %	0 %	0 %	397677597
119	NC_018146	TAA	2	6	10630	10635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677597
120	NC_018146	A	6	6	10642	10647	100 %	0 %	0 %	0 %	397677597
121	NC_018146	ATG	2	6	10695	10700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677597
122	NC_018146	CAT	2	6	10704	10709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677597
123	NC_018146	CAA	2	6	10725	10730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677597
124	NC_018146	A	6	6	10729	10734	100 %	0 %	0 %	0 %	397677597
125	NC_018146	CCAT	2	8	10735	10742	25 %	25 %	0 %	50 %	397677597
126	NC_018146	A	6	6	10764	10769	100 %	0 %	0 %	0 %	397677597
127	NC_018146	GTTT	2	8	10783	10790	0 %	75 %	25 %	0 %	397677597
128	NC_018146	CAG	2	6	10801	10806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677597
129	NC_018146	TA	3	6	10815	10820	50 %	50 %	0 %	0 %	397677597
130	NC_018146	AGA	3	9	10829	10837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677597
131	NC_018146	T	7	7	10841	10847	0 %	100 %	0 %	0 %	397677597
132	NC_018146	T	6	6	10859	10864	0 %	100 %	0 %	0 %	397677597
133	NC_018146	A	8	8	10868	10875	100 %	0 %	0 %	0 %	397677597
134	NC_018146	A	8	8	10879	10886	100 %	0 %	0 %	0 %	397677597
135	NC_018146	A	8	8	10888	10895	100 %	0 %	0 %	0 %	397677597
136	NC_018146	A	7	7	10919	10925	100 %	0 %	0 %	0 %	397677597
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.